王允借呂布之力殺掉董卓後，在如何處置涼州兵的問題上，朝令夕改，進退失據，他本是打算全部赦免董卓的部曲，呂布也數次勸他應該這麼做，但後來他又改變主意，認爲：“此輩無罪，從其主耳。今若名爲惡逆而特赦之，適足使其自疑，非所以安之之道也。”又決定不專門下詔赦免涼州兵，而決意打算把他們解散掉，使各歸鄉。
這個時候，有人上言，進諫於他，說：涼州人素憚袁氏而畏關東，今若一旦解兵，則必人人自危。可以皇甫義真爲將軍，就領其衆，因使留陝以安撫之，而徐與關東通謀，以觀其變。
皇甫嵩名震天下，戰功赫赫，品德又好，且還是涼州人，用他來接替董卓，是足以鎮撫涼州諸軍的，可王允卻不同意這個建議，他回答以“關東舉義兵者，皆吾徒耳。今若距險屯陝，雖安涼州，而疑關東之心，甚不可也。”仍是決定要解散涼州兵。
呂布既有了協誅董卓的功勞，被王允用朝廷的名義拜爲奮武將軍，進封溫侯，於政治待遇上則假節，儀比三司，得以與王允共秉朝政，遂因此而頗有了些政治抱負，先是數勸王允赦免董卓部曲，繼又請求以董卓的財物賜給公卿、將校，以安人心，殊不料王允名義上雖給了呂布顯貴的職務，而實際上卻是以“劍客”之徒來視呂布的，自然不肯聽從他的建議，這樣一來，呂布、王允兩人的內部之間就出現了矛盾。
同時，王允因誅滅了董卓，自以爲從此之後，朝廷無復患難，居功自傲，每與羣臣集會，不再像以前那樣與諸臣推心置腹，共同商討權宜之計，而是正襟危坐，面無溫潤之色，於是，羣臣也就不是很擁戴他了。和羣臣之間，王允亦出現了不和，乃至殺掉了大名士蔡邕。
內已不和，王允外又不聽從別人的進言，堅持要把涼州兵全部解散，這樣就導致長安出現了緊張的局面。
董卓死後，涼州兵羣龍無首，本即不安，又聞王允欲罷其軍，如李傕、郭汜之輩惶恐不已，不知適從，有心解散部隊，可因無朝廷的赦書，又擔憂既然這般做了，到最終仍是難逃一死。
時勢造英雄，英雄造時勢，當時勢隨着事態的進程發展到轉折口時，有時候，一個人、幾句話就可以決定其接下來的走向，使之或向左、或向右繼續前進，——賈詡就是有這樣能力的一個人。賈詡時在李傕軍中，他對李傕說道：“聞長安中議欲盡誅涼州人，而諸君棄衆單行，即一亭長能束君矣。不如率衆而西，所在收兵，以攻長安，爲董公報仇，幸而事濟，奉國家以徵天下，若不濟，走未後也。”所謂“奉國家以徵天下”，實即挾天子以令諸侯。
此策一出，李傕等俱皆以爲然，乃與郭汜、張濟等涼州將校結盟，率兵數千，西攻長安，王允遣董卓舊部迎戰，被李傕、郭汜擊敗，反降於李、郭。李傕等沿途收攏部隊，到達長安時衆已至十餘萬人，再又與董卓的舊部樊稠、李蒙、王方等會合，兵勢愈振，共同圍擊長安城。
呂布以一己之力敵李傕等諸將校之攻，守城十餘日，結果因城內叟兵之叛，——叟，是青羌的一支，叟兵即是由叟人組成的部隊，涼州兵中多羌人，故此叟兵與之暗通，進而叛變，他們叛變後，打開了城門，迎涼州兵入城，呂布由是戰敗，只帶了百餘騎殺出重圍，東逃出關。
呂布出逃時，招呼王允共走，王允以“天子年少，不能棄天子獨逃”爲由拒絕了呂布。
李傕、郭汜兵入長安，當時就想殺了王允，然卻因左馮翊宋翼、右扶風王宏既是王允的同郡人，又是王允所拜任的，三輔人口多、兵谷富實，李傕、郭汜等憂宋翼、王宏或會爲患，乃先徵他兩人入朝，王宏看出了李傕、郭汜的目的，不欲入朝，而宋翼以“王命所不得避”爲由，決定應徵，王宏不能獨立，遂俱就徵，到了朝中，兩人與王允一起被殺。
王允的三個兒子及宗族十餘人並皆遇害。司隸校尉黃琬等不少的大臣亦被誅殺。
朝廷拜李傕爲揚武將軍，郭汜爲揚烈將軍，樊稠等皆爲中郎將。
王允殺掉了董卓後，曾遣張種撫慰關東，張種現如今尚未到達兗、徐，李傕、郭汜遣人傳檄，將他召回朝中，改遣太傅馬日磾、太僕趙岐持節巡行關東。
馬日磾、趙岐行至洛陽，馬日磾上表，請求讓趙岐另外出使，因李傕有意與袁術結盟，希望袁術能成爲他的外援，故以朝廷的名義拜袁術爲左將軍，封陽翟侯，假節，所以馬日磾、趙岐兩人於洛陽分手後，趙岐北往冀州，馬日磾則去了南陽，代表朝廷給袁術進行拜授。卻令人沒有想到的是，袁術在接受了朝廷的封拜之後，竟奪走了馬日磾的節，把他扣留在了南陽。
這道消息傳到郯縣，荀貞於覽報之同時，即猜出了袁術之所以這麼做的原因。
正當袁術與劉表爭荊的重要關頭，袁術自是不願劉表再獲得任何一點的朝廷大義，所以爲不讓馬日磾南下襄陽，他索性將之扣留于軍中。
荀貞心道：“袁公路驕橫跋扈，此舉荒唐至極！”想及孫堅不久前徵詢自己意見、問該不該出兵援助袁術的來信，因便回信給孫堅：袁公路方扣使節，輕辱朝廷，不宜即援助之。
平衡荊州各方割據的勢力，務必不使劉表或袁術一支獨大，這確是荀貞目前對荊州的既定方略，可袁術眼下並未大敗，只是和劉表、黃祖陷入了消耗戰，所以在軍事上不需要立即對他進行相援，他胡亂非爲地把馬日磾給扣留住了，在政治上更是不能於此時發兵往助。
趙岐北行，到魏郡，雖值與公孫瓚交戰的危機時刻，袁紹仍是出迎百里。