先島羣島雖然離臺灣的海路不足一百里，但卻是屬於琉球羣島的最邊緣地帶。_）而這時的琉球王國早己經淪爲曰本薩摩藩的傀儡政權，因此商家軍在石桓島和西表島建立了海軍基地的消息，也很快就傳到了薩摩藩所在的日本鹿兒島。
這個時候薩摩藩在曰本戰國末期的幾位風雲人物島津勝久、島津貴久、島津義久、島津義弘、島津忠桓等人都己作古，現任的藩主是島津忠桓的次男島津光久，現年三十歲，是在三年前繼任薩摩藩大名。
現在琉球王國是薩摩藩財政收入的主要來源。薩摩藩也視琉球羣島爲自己的私人禁地，不許他人插手，那怕是邊緣地區，也不例外。因此島津光久得知明軍在石桓島和西表島上建立海軍基地之後，也大吃一驚。第一反應就是這一定和鄭芝龍有關，因爲在島津光久的映像中，明朝只有鄭芝龍有船隊在海上活動。
薩摩藩和鄭芝龍到還有一些生意來往，因此島津光久在立刻派出弟弟島津忠朗爲使者，前進西表島，向駐守那裡的明軍提出交涉，並要求明軍立刻撤離先島羣島地區。
那知島津忠朗到了西表島之後，發現駐守在這裡的其實是西班牙軍，也不禁大爲震驚，因爲他們只帶了中文通譯，而西表島也沒有日語翻譯，只有兩個會一些中文的傳教士，結果雙方溝通十分麻煩，必須先譯成中文，再分別譯成西班牙語和曰語，但日本的翻譯和傳教士對中文的理解上，又有很大的差別，結果說了半天，雙方都沒有完全弄明白對方的話。
只是有幾件事件，島津忠朗總算是弄清楚了，佔領西表島的明軍與鄭芝龍並無關係，這支西班牙軍是受僱於一個叫商毅的明朝候爵的私軍，但島津忠朗也不知道這個商毅是何許人也。而西班牙軍的主將莫亞的理解是，對方也想佔領西表島，但晚了一步，因此要求自己離開，好把這個島讓給他們。這下雙方當然談不好，莫亞的態度越來越強硬，而島津忠朗則認爲對方是蠻不講理，結果自然是不歡而散。
島津忠朗回到琉球之後，仔細一打聽才知道，這個商毅是海上的一股新興勢力，好像和荷蘭人打過一仗，還佔領了臺灣。等他回去向島津光久報告之後，島津光久也百思不得其解，有心派人到明朝去面見明朝的皇帝，但一來太耗時間，也不知那裡去找門路，島津光久畢竟也是一藩之主，當然知道那一個國家的官場這趟水不好走，商毅既然敢公然侵佔先島諸島，一定是有所倚仗，就是找到明朝的皇帝，也未必能讓明軍撤離，當然薩摩藩以武力脅迫控制琉球王國的事實，則被島津光久直接無視掉了。
因此島津光久最終還是決定，還是用武力來解決。以這近百年來明朝的態度看，對海外並不感興趣，馬尼拉的華人被大屠殺後，明朝沒有理，而薩摩藩侵佔琉球王國之後明朝也沒有理。因此這次自己用武力奪回西表島和石恆島，估計明朝還是不會理。
不過現在的薩摩藩可不是當初關原之戰時的曰本強藩，封地被徳川幕府削減了大半，精兵強將也損失大半，而且又缺乏水軍的力暈，島津光久又下令徵集船隻，組織軍隊，結果花了幾個月的時間，才總算是徵集齊了六十餘艘大小船隻，軍隊六千餘人，由島津忠朗出任主將、並率領伊勢貞行、平田宗興、樺山久平等家臣大將，收復西表島和石垣島。
不過在這幾個月的籌備時間，島津光久也打聽到一些先島明軍的情況，他們的總兵力約爲兩千左右，還要分守兩個島，而戰船也不足二十艘，因此以自己這樣的兵力，奪回這兩個島還是綽綽有餘的。而島津忠朗也是信心十足，帶領着船隊出發。
薩摩船隊首先停靠琉球，以琉球王朝的都城首裡爲後方基地，然後刀向先島諸島進攻過來。而島津忠朗派家臣樺山久平爲先，率領三十艘戰船，攻領先島諸島東北的宮古島，爲前方基地。
樺山久平是薩摩藩的名將樺山久義之後，而樺山久義正是幫助薩摩藩控制琉球的主要功臣，樺山久平也很以自己先祖爲豪，只是他出生之後，曰本己統一在德川幕府的旗下，薩摩藩也無力與德川將軍相抗爭，因此只有老老實實做了順民，承平日久，武士也無建功立業的機會。因此樺山久平也己經感嘆自己晚生了幾十年，沒有趕上那個叱吒風雲的大時代。
而現在總算是有了出戰的機會，因此樺山久平也興奮異常，決心在這次戰鬥中一定要立下武勳，也爲樺山家增加榮耀。因此在攻佔了平良島之後，樺山久平也不顧主將還沒有趕到，就留下少數兵力守衛平良島，自己帶領着大隊船隊，向石垣、西表兩島進攻過來。
薩摩船隊到平良島之後，立刻被西表、石垣二島上的西班牙軍發現，兩名西班牙軍官莫亞和阿爾維斯經過商議之後，決定率領船隊主動出擊，先給薩摩船隊一個迎頭痛擊，同時也派人向浙江報急，也派人到臺灣，請駐守臺灣的沈壽嶽派兵來支援。
正好這時樺山久平也率領着艦隊向石垣島進發，雙方在先島諸島中部的水納島海域遭遇，展開激戰。
在這一戰中，西班牙僱傭艦隊一同投入十五艘戰船，都是中小型戰艦，最大的是八百噸的皇家園林巡遊者號，另外還有四艘七百噸戰艦、六艘六百噸戰艦，四艘五百噸戰艦。而薩摩船隊出動了二十六艘戰船，不過這時日本的造船技術十分落後，最大的一艘也不超過五百噸，還有八艘兩百噸以下的小船。結果一方船少但體大，而另一方小則多，算成總噸，還大致相當。
但一打起來可就滿不是那麼回事了，因爲曰本的海戰理念依然停留在當初的豐臣秀吉侵朝戰爭時代，仍然是以靠近用火箭射，然後接舷跳幫戰爲主要戰術，薩摩船隊的船小不說，而且配有火炮的戰船竟還不足十艘，而且最多的一艘戰船上裝配的火炮只有八門，還都是小炮。而西班牙僱傭艦隊隨便拉出一條船的火炮都要超過它們一倍，而旗艦皇家園林巡遊者號，一共裝配了七十門火炮，一下子就要把薩摩船隊比化了。
結果一戰下來，薩摩船隊被打得大敗，被擊沉六艘，俘虜二艘，拆兵六百餘人。樺山久平帶領着敗軍逃回平良島去了。而西班牙僱傭艦隊僅僅只被燒燬一條船，受傷兩艘，損失了三十四名士兵。
不過儘管西班牙僱傭艦隊在第一戰取得大勝，但薩摩船隊的後隊趕到了平良島之後，戰船總數超六十艘，雖然船小炮少，但也是蟻多咬死象，莫亞和阿爾維斯也不敢輕易向宮古島發動進攻，因此把戰船集中在西表島和石垣島之間，兩面支持，而同時駐守臺灣的沈壽嶽也拔來了一千士兵，六艘船，幫助守島。只等浙江派來援軍。
――――――――分割線―――――――――分割線――――――――
商毅現在當然還不知道雙方水戰的結果，不過對這次中日之間的衝突可以不敢馬虎，他對日本本來就沒什麼好感，只不過是現在騰不出手來收拾他們，何況這一回小日本居然主動惹到自己頭上來了，那自然也就不會客氣。
而且商毅也十分清楚，這個時代的日本頗有些向一百年後的中國，閉關自守，承久太平，戰國時代的尚武精神和血氣之勇己被太平時光消摩得差不多了，而武士道瘋狂精神還要等到二百多年以後，纔會出現，因此也可以說，現在的日本正是國力隆盛，但武力鬆馳的時候。
商毅當然不會對日本講什麼費尓沷賴精神，相反越是落水狗，就越是要痛打。而且自從商家軍走向海洋之後，向南的目標就是馬尼拉，而向北的目標就是琉球，這是這兩處地方，正是東亞及東南亞海域的南北要路，佔領西表島和石垣島只是第一步，商毅正愁沒機會對琉球下手，想不到曰本人主動把機會送上門來了，這可是上門的買賣不得不做啊。雖然現在以自己的力量，攻打馬尼拉還頗有不足，但對琉球動手，還是足夠的。
因此就在很短的時間裡，商毅就做出決定，一次不僅僅是要把薩摩藩痛打一頓，讓他們知道疼爲止，而且一定把自己的海上勢力插入到琉球羣島內部。同時也是對整個曰本的一次搞山震虎，看一看徳川幕府會有什麼反應。
於是商毅也立刻決定，取消今天下午視查兵工廠的行程，招集海軍將領開會，商討這次這次對曰本薩摩藩的戰鬥安排佈置計劃。也命成進和黃震馬上去通知安排，讓海軍將領明天上午都趕到督師衙門來開會。
成進和黃震離開了督師衙門以後，商毅忽然想到在杭州還住着一個充滿了疑點的日本商團，而且這個日本商團就是來自薩摩藩，那麼這次的戰爭和他們會不會有什麼關糸呢？因此商毅也立刻下令，讓人把安全處的付責人周奇找來，問一問曰本商團的情況。